洪泽湖养殖区底泥微生物分离研究毕业论文_生态学毕业论文

洪泽湖养殖区底泥微生物分离研究毕业论文

2021-04-27更新

摘 要

湖底底泥是众多微生物寄生的重要区域,许多对水产品养殖具有反作用的微生物会肆意破坏养殖体系中的生态平衡。加之水体中微生物种类密集繁多,数量也相对较大,通过对水体微生物的鉴定、分离即可研究水体中的微生物种类、结构以及微生物多样性,并加以研究。本研究课题利用从洪泽湖的养殖区采集底泥样品,通过对相关菌株的分离、培养、筛选的研究方法,试分离相关微生物进行分类及特性研究。得出实验结论:首先,利用菌株PCR和16SrDNA序列对微生物进行扩增和排序,可以清楚明确的辨别底泥微生物所属的科,扩增过的DNA可以通过观察和数据库比对找出相应的所属科,并且相似度均在90%以上。其次,通过生理特征可以对抗生素性状进行分析,也可以通过生理特征的方式对细菌种间、亚种间乃至株间的亲缘关系进行分析。同时延伸出的PAPD技术也可以对未知菌株的快速鉴定和菌种引起的流行病学进行调查,还可以加强对环境抗药性基因检测方法的研究,并对耐药微生物和抗药性基因的环境生物学和生态效应等研究领域进行积极的探索。

关键词:微生物分离;底泥微生物;筛选分类研究

Isolation and classification of microorganism from sediment of Lake Hong-Ze

ABSTRACT

Sediments play an intermediate role in the eutrophication of freshwaters and may result in the release or uptake of nutrients. Microorganisms are regarded to be among the most important players in freshwater ecosystems by transforming or mineralizing organic matters. More specific functions of the freshwater microbes can be revealed using technologies such as deep sequencing. To date, many studies have examined the microbial community in the water column, where as research on the microbial community of the sediments has been limited. The classification of microorganisms is continuously changing as a result of progressive developments of analyses. In this study, we used the sediment samples from the Lake Hong-Ze to isolate and classify the bacteria from the sediment samples. The experimental results are as follows. First, the amplification and sequencing of microorganisms using bacterial PCR and 16Sr DNA sequences can clearly and clearly identify the families to which the sediment microorganisms belong. And amplified DNA can be observed and compared to the database to find the corresponding family, and the similarity is more than 90 %. Then, we can use PAPD technique to analyze the characteristics of antibiotics. This technique can also analyze the genetic relationship between bacterial species, subspecies, and even strains. At the same time, it is also possible to investigate the rapid identification of unknown strains and the epidemiology caused by strains. It can also strengthen the research on the detection methods of environmental resistance genes, and actively explore the research fields of environmental biology and ecological effects of drug-resistant microorganisms and drug-resistant genes.

Key words:Microbial taxonomy; sediment; bacterial screening

目录

1 前言 1

1.1研究背景 1

1.2研究目的及意义 1

1.3国内外同类研究现状 1

1.4洪泽湖养殖区概况 2

1.5微生物基因的分类与鉴定方法 2

1.5.1(G C)mol% 2

1.5.2 16SrDNA序列分析 2

1.5.3通过生理特征区分亲缘关系相近的细菌 3

2 实验材料及方法 4

2.1实验材料 4

2.2实验方法 4

2.2.1细菌的分离、培养与保存 4

2.2.2细菌 DNA 提取方法 5

2.2.3测序 5

2.2.4基于16S rDNA系统树制定 6

3 实验结果与讨论 8

3.1实验结果 8

3.2所测菌株S2的16SrDNA序列分析 8

3.3讨论 13

结论 14

致谢 15

参考文献 16

1 前言

1.1研究背景

自然环境介质中的微生物是抗生素的产生者,自然环境介质中抗生素产生及其抗生现象属于微生物自然防御机制[1]。同时微生物产生的抗生素会对环境有不容小觑的影响和污染。虽然自然环境微生物产生的抗生素浓度非常低,但是目前对环境的污染主要来源于工业生产的医用抗生素和兽用抗生素,这些残留在环境中的抗生素主要通过医用污水废物、使用者粪便、畜禽与水产养殖水废物以及生产企业的废水废料排放、垃圾渗滤液污染、粪便农用等多种方式进入环境中[2],并影响着环境。环境残留的抗生素可诱导致病微生物产生抗性基因,而耐药致病菌对人类健康威胁巨大,尤其是具有多药物抗性的超级致病菌[1]。同时,随着分子生物学的进步,并在许多生物学家的不断努力下,自表现性分类法 、PCR技术之后,微生物的分类鉴定进入了分子水平,生出了各种基因型分类方法,如(G C)mol%、DNA杂交、rDNA指纹图、质粒图谱和16SrDNA序列分析[3-6]

1.2研究目的及意义

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